Departamentul Navigatie si Transport Naval s-a infiintat in anul 2013 ca urmare a reorganizarii Academiei Navale "Mircea cel Batran" si reuneste toate disciplinele necesare formarii ofiterilor de punte de nivel operational si managerial pentru marina comerciala. De asemenea, Departamentul Navigatie si Transport Naval asigura cadre didactice de specialitate necesare formarii ofiterilor de punte pentru Fortele Navale.
Fisele disciplinelor respecta normele academice, prevederile codului STCW 78/95, amendamentele conventiei de la Manila si ale modelelor de curs IMO 7.01, 7.03.